Het bestuur van de Stichting bestaat uit drie leden. De activiteiten van de Stichting worden ondersteund door vrijwilligers. De Stichting zoekt financiële ondersteuning van zowel charitatieve organisaties als particulieren. De Stichting beschikt over een zogenaamde ANBI-status, waardoor particuliere donateurs gebruik kunnen maken van een aantrekkelijk fiscaal regime.

Stichting Toverfluit is afhankelijk van donaties van particulieren en organisaties. Donaties kunnen bestaan uit een financiële bijdrage of het voorzien in de middelen waar wij bij de uitvoer van projecten behoefte aan hebben. Stichting Toverfluit wordt onder andere ondersteund door: